三方协议和劳动合同几乎是每个高校毕业生都会碰到且无法避免的东西，两者从本质上来说有很大的差异。唯一的相同之处就是为了保护当事人和公司的权益。说到两者的区别，我认为主要有以下几点。
第一、签订时间不同。三方协议一般是毕业年级的学生需要签订的，也就是学生还在校的时候和企业、学校签订的就业协议。对于很多学校而言，学生只有签订了三方协议才算是确保他已经就业，也完成了一项就业目标。因为三方协议里面包括了用人单位的承诺，你毕业后可以直接去工作，需要满足什么条件之类的内容。劳动协议则是指当应届生已经取得了毕业证书，办完左右毕业手续，到单位报到的时候，需要和公司签订的劳动合同，以保证双方的合法权益。
第二、签订的主体不同。一般来说，三方协议正如其名字一般，有三个主体，且一式三份，。分别是学校、毕业生、用人单位，需要三个单位同时确认，负责人签字盖章才算是生效。三方协议对学校而言是确认学生的就业情况的最好依据，学生需要以此确保毕业后有单位可去，用人单位则以此预定自己心仪的人才。而劳动合同的主体就不同，一般只有两方，即劳动者和用人单位，二者在充分知晓对方条件的情况下签订。
第三、签订的内容不同。三方协议的主要内容是毕业生如实告知对方自己的条件，并且愿意毕业后去对方单位工作的承诺。里面包含了学生个人意愿、用人单位接收意愿和学校同意推荐学生就业的态度。劳动合同则完全不同，其内容包括劳动者和单位各自的职责和需要履行的义务，对员工需要做什么，能够获得怎样的报酬有明确的规定，是劳动关系确定最关键的法律凭证。
第四、二者适用的法律不同。三方协议的制定、发生争议后出现问题，解决的主要依据是《国家关于高校毕业生就业的规定》、《民法典》等法律。劳动合同的签订和保护则不同，其订立以及发生争议后解决的主要是依据《劳动法》和《劳动合同法》。所以，二者在遇到问题以后，能够维护其合法权益的参考法律并不相同，赔偿规定也会有相应的不同之处。
1、二者签订的法律依据不同：
三方就业协议书是国家教育部统一印制的，主要是明确三方的基本情况及要求。三方就业协议书制定的依据是国家关于高校毕业生就业的法规和规定，有效期为：自签约日起至毕业生到用人单位报到止的这一段时间。
而劳动合同是受《劳动法》和《合同法》的限定和保护，有些用人单位如许多外企在确定录用时（注：在到用人单位报到前），就同时要求和毕业生签订一份类似劳动合同的协议；而更多的用人单位则要求先签“就业意向书”，毕业生报到后再签订劳动合同。
2、签订的主体区别：
就业协议是三方合同，它涉及学校、用人单位、学生等三方面，三方相互关联但彼此独立；而劳动合同是双方合同，它由劳动者和用人单位两方的权利、义务构成。
3、三方协议与劳动合同相继关系：
毕业生签订就业协议时仍然是学生身份，但是签订劳动合同时应当是劳动者身份。劳动合同一经签订，就业协议的效力应当丧失。若劳动合同与三方协议附件内容矛盾，则以劳动合同为准。