签订三方协议并不会影响应届毕业生的身份。

应届生主要参考如下：

1、毕业时有没签三方协议，签了三方的话报到证上会有报到单位认为就业；

2、有没缴纳社保，审核严格的单位可查社保看其有没工作；

3、可否由学校按应届毕业生派遣报到证一般为2年有效期如果过期，自己确未工作，可回学校重开报到证按应届毕业生派遣；

4、应届生签了三方后，身份还是应届生；

5、三方协议书只是三方签订的就业意向，不是劳动关系的法律文件，对劳动关系没有约束力。

毕业生签订三方协议流程如下：

1、毕业生认真如实填写基本情况及应聘意见，并签名；

2、用人单位、主管部门及人事调配部门签定意见；

3、用人单位一定将档案详细转递地址填好；

4、各院系签意见；

5、学校就业指导中心签意见。

三方协议是《普通高等学校毕业生、毕业研究生就业协议书》的简称，它是明确毕业生、用人单位、学校三方在毕业生就业工作中的权利和义务的书面表现形式，能解决应届毕业生户籍、档案、保险、公积金等一系列相关问题。